Информационная биология
Разработан комплексный подход к распознаванию сайтов связывания транскрипционных факторов, основанный на четырех методах: (i) весовой матрицы, (ii) информационной меры, (iii) многомерного выравнивания, (iv) парного выравнивания с наиболее похожим представителем известных сайтов. Показано, что среди рассмотренных методов нет оптимального для сайтов всех типов, поэтому в каждом случае необходимо выбирать наибо-лее подходящий способ распознавания. Предложенный подход позволил снизить ошибки распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов. Создана доступная через Интернет программа (http://www.sgi.sscc.ru/mgs/programs/multalig/), предназначенная для по-иска потенциальных сайтов связывания факторов транскрипции в нуклеотидных последова-тельностях, заданных пользователем.
Дополнительные материалы: | HTML |
Ваши комментарии |
[Головная страница] [Конференции] [СО РАН] |
© 2001, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
© 2001, Объединенный институт информатики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт вычислительных технологий СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт систем информатики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт математики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Институт вычислительной математики и математической геофизики СО РАН, Новосибирск
© 2001, Новосибирский государственный университет
Дата последней модификации 06-Jul-2012 (11:45:21)